衛生局表示，在「8.23」風災後，局方首要任務是預防傳染病的爆發，立即加強監測各類傳染病的疫情，加派人員到衛生黑點開展大規模消毒殺蟲工作，以及密切留意發熱病人感染登革熱或其他傳染病的情況。衛生局稱，風災後本澳未有嚴重傳染病爆發，成功遏止了疫症發生，反映災後預防傳染病措施的有效性，同時顯示本澳公共衛生防疫系統的穩健性，表明了特區政府在過往抵抗傳染病的經驗中打下堅實基礎。
衛生局指出，近十多年來，本澳陸續受到「沙士」疫情、登革熱、禽流感、流感大流行、埃博拉病毒病和中東呼吸綜合徵等傳染病的威脅，特區政府遵循世界衛生組織建議，採取不後悔原則，將傳染病防治放在施政工作的首要位置，成功抵禦各種傳染病威脅。2003年沙士爆發，特區政府迅速成立跨部門應變小組，在時任社會文化司司長崔世安領導下，加強分流和隔離的應變措施，強化口岸衛生管理，最終本澳只錄得一宗輸入性病例，實現了病毒零擴散、醫院及社區零感染。為此，世衛給予高度的評價。
衛生局稱，2004年公布《傳染病防治法》後，逐步完善和擴展傳染病的監測機制和網絡，又因應傳染病的發展趨勢，適時更新應對策略，定期對醫護人員進行培訓和演習，確保有足夠醫用物資儲備，完善區域通報和聯防聯動機制，又不斷投入資源增建高規格的防疫設施，以應對傳染病的爆發。此外，通過媒體發布傳染病的最新情況和防控要點，加強訊息發布，保持與香港、內地和世衛的聯繫和訊息交換，定期舉行粵港澳三地傳染病會議，鞏固和優化傳染病通報機制。
近年來，在社會文化司司長譚俊榮帶領下，進一步加強和鞏固傳染病的防控機制，加緊傳染病設施的興建，完成了公共衛生應急人員宿舍和公共衛生臨床中心，亦開始興建公共衛生專科大樓，並定期進行應急演練，加強藥物儲備和人員培訓，鞏固區域間的聯防聯動機制，提升本地的傳染病防控能力。因此，在面對甲型H1N1流感、中東呼吸綜合徵、H7N9禽流感、登革熱和埃博拉病毒病等重大傳染病的威脅，特區政府均能積極有效應對。
衛生局指出，防疫接種是最具成本效益和最有效的傳染病預防和控制措施。目前特區防疫接種計劃有預防13種疾病疫苗，種類與國際先進國家相若，比鄰近地區為多，包括近十年逐步加入預防肺炎鏈球菌、流感嗜血桿菌、水痘和子宮頸癌等疫苗，接種覆蓋率達90%以上。通過完善防疫接種計劃的實施，小兒麻痺症在2000年得到世衛認證為逹到消滅狀態。在西太區37個國家和地區中，澳門在兒童中消除乙型肝炎和消除麻疹分別於2008年和2014年成為西太區首批被世衛認證的國家和地區，比香港和新加坡更早。衛生局更每年為流感高危人羣接種流感疫苗，充分發揮社區的免疫屏障作用，更令本澳的流感情況較鄰近地區相對平穩。
衛生局重申，特區政府貫徹「預防優先」的理念，持續優化本澳的傳染病防控措施，鞏固公共衛生防線。從近年本澳成功預防甲型H1N1流感、中東呼吸綜合徵、H7N9禽流感和埃博拉病毒病等重大傳染病，可看出特區政府在防控傳染病方面所取得的成效，保障了居民的生命安全，都離不開特區政府對衛生資源的大量投入，以及衛生政策的貫徹落實和執行，全體醫護人員的努力和市民的積極配合。
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